HALO 4.1 发布说明
软件更新 | 2025 年 2 月
仅供研究使用
HALO v4.1
新功能
- 图像制作器（Figure Maker）：保存正在进行的图像以便稍后编辑
- 遵循 HALO Link 的研究级权限
- 重新设计的布局，与新的 HALO Link 图像制作器保持一致
- 图像视图设置应用
- 每个通道单独应用自动适配视图设置计算
- 批量应用视图设置，无需导出/导入
- 图像视图设置直方图
- 可比较多个已打开图像的直方图
- 显示相对强度值
- 显示真实伽马值和伽马曲线
- 可使用对数视图
- 高通量图像（highplexed images）表型设置优化
- 新的设置选择网格
- 一次性为所有通道设定逻辑
- 实时查看每个表型的调优标记
- 分析标签页中显示表型预览列表
- 支持将表型逻辑导出为
.csv
- HALO 图像写入器生成 OME.TIFF 图像
- 拼接组件
.qptiff - 融合的序列染色
- 导出全分辨率图像
- 静态标记图像
- 拼接组件
- 更新的用户通知
- 所有通知显示在 HALO 右下角
- 支持同时显示多个提醒
- 点击即可关闭通知
- 可选记录错误消息以便故障排查
分析模块更新
- 高维分析模块（High Dimensional Analysis） - 新增
- 无监督聚类
- 降维图
- 在图像、对象数据和图表之间保持交互性
- Highplex FL 模块 v5.0
- 支持阈值辅助（Threshold Assist）工作流
- 支持上文所述的高通量表型设置优化
HALO AI
- AI 标注工具改进
- 改进的 UI/UX
- 支持多图像
- 原生支持 FL 图像
- 分类器流水线
- 标记下拉菜单显示分类器名称
- 第一个标记叠加层显示最终步骤结果
- AI 应用（AI Apps）支持改进
- 简化批量分析
- 在 HALO 界面中提供 AI Apps 用户指南
- 额外的批量工作流
- 批量将分类器训练区域移动到标注标签页
- 批量删除验证标注集
- 支持导出最终定型的分类器
已移除的功能
- 手动点击计数器 - 已由针状标注工作流替代
- GRPC 服务器 - 已由 GraphQL 服务器取代，成为唯一 API
- 自 HALO v4.0 起，不再测试或正式支持与 eSlide Manager 的集成
即将移除的功能
无
Bug 修复
结果与导出
- 当区域设置不同，无法生成自定义计算
- 高级导出时检测到 OpenGL 错误
- 批量处理后，分析结果和标记未立即显示
- 加载相关结果/对象数据时延迟过长
- 多研究高级导出报错
- 高级导出在导出分析设置和标记缩略图时卡住
- TMA 高级导出未填充所有对象数据列
标注
- 与 Concentriq 兼容的 5 点矩形标注
- 旋转矩形标注会更改标注区域和分析区域
- 截断的标注 regionID 导致选择异常
- 在迁移过程中，旋转图像上的标注位置不正确
- 导出 geoJSON 格式标注时报错
- 导入的矩形标注无法复制
- 反射和旋转图像上的画笔标注翻转
- “保存标注”按钮错误地处于启用状态
- 导入标注失败 - 正文大小限制
- 删除标注时的查看器导航行为不一致
- 删除所有图层后无法保存标注
- 多个平铺图像时标注工具栏被截断
- 对多个小标注进行同心分区时出现多个错误提示
分析
- 队列中重新提交旋转图像的 FOV 分析不保留旋转
- 按优先级排序分析任务时报错
- 即使分类器存在，仍显示“分析设置包含 HALO 中未找到的分类器”
- 空间分析任务卡在队列中
- HALO 客户端在本地和批量分析中空间分析失败
- 对标注区域的分析失败或跳过区域
- 当实时调优窗口部分超出图像范围时，标记未显示
- 分析设置中的重复名称导致 Multiplex IHC 中异常和错误汇总数据
- TMA 标签页中“分析整个图像和标注图层”选项仅对最后一层可见
- 在渗透分析对象数据上完成空间分析失败
- 当通道名称为数字时合并属性失败
- 渗透分析可在无界面层情况下启动
- 网络中断时标记图像绘制空白切片
- 空间分析汇总数据导出缺少分析区域图层名称
分类器与 AI
- 使用 AI 默认核分割时作业工作器卡死
- 拥有者权限的标准用户无法保存分类器流水线
- AI 表型分类器在移动前不渲染分割
- 选择分类器训练区域会跳转到未旋转位置
- 在旋转图像中对未旋转区域进行分类器训练
- 难以从标记中选择孤立的分类器对象
- Slide QCv3 和 AI Apps 未标记为预训练分类器，可被覆盖
- GPU 作业被 CPU 节点接管用于重新提交的分析
- 加载分类器窗口有时加载缓慢
- 非连续类别 ID 的对象表型验证对象数据错误
- 未保存的 AI 分类器在默认 2500 次迭代检查点抛出未处理异常
- HALO-only 客户端无法批量提交嵌入式 AI 模块分析
- 分类器名称超过 100 个字符时提交作业触发 GraphQL 错误
- 删除已保存的预训练分割分类器时同时删除权重文件
- 带有额外训练的 SlideQCv2 模型无法导入
- 注册的跨图像模态序列切片上的嵌入分类器失败
- 在分类器标签页修改画笔标注无效
- 允许为分析和分类器标记设置不同透明度
图像查看器
- 改进图像切片加载与渲染
- 移动查看器时标记图像闪烁
- HALO 将 ER.QPTIFF 图像读取为 12 位，截断 14/16 位
- 改进 10/12/14 位图像的读写支持
- 在图像标签页间切换时卡顿
- 关闭图像时报未处理异常
- FL 通道显示的像素强度值不正确
- 区域设置导致视图设置导入错误
- 浮动通道框时关闭图像导致其消失
- HALO 快照不包含比例尺
- RTT 的标记按钮在关闭后切换图像时无响应
- NDPI 错误 - 文件过大：更新 SDK
- 初始白值与分辨率导致 Hyperion 图像显示异常
- 无法打开未知压缩格式的 VSI 图像
- 显示 FL 像素强度时，平铺 FL 图像触发异常
- 支持 Morphle Labs 的稀疏平铺 DICOM 图像
- 打开带不可访问标记图像时报异常
- MIBI .TIFF 融合图像的通道最大值被截断
- FL ImageJ TIFF 的通道最大值不正确
- 支持多文件 OME.TIFF
- 图像缩放与实时调优窗口存在差异
- 打开相差 CZI 图像时报错
- 序列染色融合的通道最大值未正确转换
- 对分块/条带式 SVS 性能优化
- 对 .LIF Z 轴堆栈图像添加无效文件错误提示
- 改进一次打开 18+ 图像的加载
- 打开 .LIF 裁剪源图像时报错
- 更容易关闭 FL 通道颜色选择器
- QuPath 裁剪的 16 或 32 位 OME-TIFF 无法正确打开
- 图像制作器中无法添加含多个已打开图像的面板
配准
- FL 序列染色图像的对齐问题
- 在非活动图像上放置配准标记时不显示
- 配准过程中分辨率值不正确或为 0 时触发异常
- 批量图像配准
.MRXS文件时报错
系统
- 选择不同研究后图像列表延迟加载
- 无法将裁剪图像保存到 NAS
- HALO Link 用户组权限阻止分割 TMA 分割显示
- API 网关未正确处理 "CloseReceived" 状态
- HALO 安装程序间歇性丢失 segment anything 模型权重文件
- 提高迁移性能，使标记图像宽度与分析任务区域宽度匹配
- 增加 SQL 和 SignalR 超时默认值
- 无法创建离线安装包
- 在 ASP.NET Cookies 中添加 "secure"
- GraphQL Workbench 的工具提示卡住显示
- 非正常退出后 HALO 无法启动
每个 HALO 版本都会新增功能和更新模块。
这些改进可能会导致不同版本 HALO 的分析结果略有差异。
如需更多信息或有任何问题，请联系 support@indicalab.com
访问 Indica Labs 在线学习门户 以了解更多新功能信息。